牡丹是我国固有花卉，具有悠久的栽培传统。菏泽地处鲁西黄河冲积平原，土层深厚，土质疏松，土地肥沃；春季干旱，夏秋多雨，是牡丹最适宜的生长区之一。菏泽牡丹始于隋，兴于唐、宋，盛于明、清，至清成为中国牡丹栽培中心，至今已有1000多年的种植历史。目前，全市牡丹种植面积达到46万亩，有9大色系、10大花型、1237个品种，菏泽是目前世界上面积最大的牡丹繁育、栽培、科研、加工、出口和观赏基地。

    2002年通过国家组织论证的“菏泽牡丹原产地注册”，2006年被评为“中国牡丹城”，2012年被命名为“中国牡丹之都”。牡丹全身都是宝，除了观赏价值，蕊、花、茎、叶、根都有很大的开发潜力，目前已成功研制一批深加工产品，由过去的单一观赏、药用逐步走上全方位、多层次、综合性的开发生产之路。近年来，菏泽市组织相关技术人员对牡丹展开了全方位、多层次的综合研究开发，成功探索出系列牡丹综合开发资源化利用路线。主要包括：牡丹花的资源化利用、牡丹花粉的资源化利用、牡丹根的资源化利用、牡丹叶的资源化利用、牡丹种皮的资源化利用、牡丹果荚的资源化利用、牡丹籽粕的高值化利用、制取牡丹营养粉、制取纳米牡丹木粉、培养牡丹菇。牡丹产业是一二三产业相互融合的全链式产业，具有综合效益好、带动能力强的明显特点。成立了中国牡丹应用研究所，组建了牡丹科研专家顾问委员会，建设了国家牡丹种质资源库（菏泽）和中国牡丹新品种测试基地，有30余项省级以上研究课题获奖。其中“牡丹籽油超临界CO2萃取标准化规模化技术研究”、“牡丹籽粕提取芍药苷方法研究”2项技术，居国际领先水平。

    2013年3月份，党和国家领导人习近平、李克强、张高丽、汪洋和省委书记姜异康分别就油用牡丹产业作出重要批示；2013年11月26日，习近平总书记专门视察了菏泽牡丹产业。经过近两年的发展，全市的牡丹种植面积已达46万亩，由往年的散户种植为主，已逐渐转变为集约种植为主。种植大户、专业企业、专业合作社相继涌现，逐渐成为牡丹基地建设的经营主体，牡丹基地建设质量显著提高。菏泽牡丹产业的发展逐渐呈现多元化的态势，已由原来的药用、种苗、观赏，开始向种苗、成品化、深加工等发展转变。目前从业人员达到10万多人，年产标准化牡丹种苗3000万株，发展花卉企业300余家。牡丹籽油、牡丹茶、牡丹催花、牡丹鲜切花等产品已批量生产，涌现出了尧舜生物、盛华产业、瑞璞艺术等一大批龙头企业。

    尧舜牡丹产业园国内首条年产10000吨牡丹籽油生产线已投产运营；正在安装牡丹籽油软胶囊、牡丹食品灌装两条生产线，明年5月投产。所有项目全部达产后，年可实现销售收入180亿元，利税24亿元。盛华牡丹产业园，2013年牡丹基地面积发展到5000亩。牡丹深加工的企业达到6家，尧舜、盛华、瑞璞、中原、琦园、蓝天蓝等企业初具规模，牡丹籽油、牡丹茶、牡丹催花、牡丹鲜切花等产品已批量生产，龙头企业带动能力进一步增强。科研能力不断增强，已发展牡丹专业科研机构17个，建设了全国最早的牡丹资源库、资源圃和新品种驯化测试中心，先后完成 “牡丹太空育种”、“牡丹不凋花”、“油用牡丹品种筛选及规范化栽培”、“牡丹籽油生产工艺研究”等技术研究60余项。“牡丹籽油超临界CO2萃取标准化规模化技术研究”、“牡丹籽粕提取芍药苷方法研究”两项技术通过科技成果鉴定，达国际领先水平。

    随着生产加工技术的深入研发，牡丹产业将扩大延伸到医药制品、日用化工、营养保健、食品加工、餐饮服务、工艺美术、食用菌、畜牧养殖、旅游观光等众多领域，发展前景广阔。